De opvallende zwarte rotsblokken bij Koh Kham zijn basaltische vulkanische rotsen, overblijfselen van een oude krater die miljoenen jaren geleden actief was. Het proces begon met een vulkaanuitbarsting, waarbij gesmolten magma opsteeg en als lava naar de oppervlakte kwam. Bij contact met lucht en zeewater onderging het een snelle afkoeling, waardoor het stolt tot een dichte, donkere rots. Eeuwenlang hebben erosie en verwering door wind en getijden de structuur van de vulkaan afgesleten, waardoor alleen deze duurzame rotsblokken verspreid over de kust achterbleven. Toen de zeespiegel stabiliseerde, bloeide de koraalgroei rond de ondergedompelde rotsen, waardoor de onderwatertuin ontstond die vandaag de dag te zien is.